• Nom du laboratoire/structure :  Laboratoire Capteurs Bactériens pour l'Analyse et le Contrôle (une partie des activités est intégrée dans l'ERT CBAC 1052)
• Laboratoire labellisé ou antenne de labo labellisé, hébergé par l'IUT (JE, EA, ERT, CNRS...)
•  Statut actuel du laboratoire/structure : ERT CBAC 1052
• Unité de rattachement : UMR CNRS 6144
• Organismes de rattachement : DS principale du MEN : 10, DS EPST : Ingéniérie
• Ecole Doctorale de rattachement : Chimie Biologie

• Mots clés : Biocapteurs / écotoxicologie / bactéries / bactériophages / biodégradation/ environnement / agroalimentaire

Présentation générale du laboratoire/structure

• intitulés des équipes de recherche : ERT Capteurs Bactériens pour l'Analyse et le Contrôle
• principales thématiques de recherche :

 points forts : recherche intégrée en génie microbien touchant les aspects lié à la mesure de l'effet de polluants chimiques et leurs mesures. Nous développons ainsi des biocapteurs bactériens pour la détection de substances polluantes dans les eaux. Dans le domaine de l'agroalimentaire et de la santé, nous développons des méthodes rapides pour la détection de contaminants bactériens dans la chaîne alimentaire. L'ERT associe de multiples compétences transversales et complémentaires soit en interne à l'UMR GEPEA soit en externe au travers de collaborations durables et effectives avec l'Université du Maine et la société Biolumine SA.

Programmes de recherche dans lesquels le laboratoire est impliqué (avec degré d'implication)

niveau régional :

• Programme CPER 2000-2006, M3Bis N° 18035, Biocapteurs Bioluminescents - Degré d'implication : porteur de projet. Coordination scientifique et administrative.Programme avec la société Biolumine
• Programme avec la société Carbofil

Demandes en cours

• Projet BioRam déposé à l'occasion de l'appel d'offre Région. Degré d'implication  : porteur de projet.
• Projet AISQUAL déposé à l'occasion de l'appel d'offre Région. Degré d'implication :  partenaire

• Dépôt de projet à l'ANR EMPB, projet SAPEB (Surveillance automatique de la pollution chimique des eaux par biocapteur). Degré d'implication : porteur de projet
• ANR ECCODYN : programme « Indicateurs biologiques et chimiques de présence, biotoxicité et biodégradabilité des hydrocarbures pétroliers en milieu aquatique continental et côtier ». Degré d'implication : Laboratoire partenaire (porteur de projet = Observatoire de Banyuls)
• Programme RITMER "EVABIODEG" (piloté par Marie José DURAND pour le CBAC), Evaluation d'une filière de traitement de pollution pétrolière accidentelle, Degré d'implication : partenaire (porteur de projet Ecole des Mines de Nantes).
• Programme de recherche avec L'Institut Français du Pétrole. Thèse débutant fin 2006 en cotutelle dans le cadre d'un programme "Evaluation of new tools for the characterization of the biodegradation capacities of microflorae". Collaboration avec le Canada.

• Intégré dans le programme COST 865 "Bioencapsulation Multiscale Interaction Analysis".
• Deux projets déposés mais non retenus (BIOFENCE et RISSOFFI), participation à un réseau Marie Curie RTN "biocapteur", projet non retenu.

• Coopération avec le laboratoire de Microbiologie de l'Université de Guelph (Canada) et le laboratoire de Génie Chimique de l'Université la Sapienza (Italie)

A l'Université du Maine. Master matériaux entre Nantes et Le Mans. Cours sur les biocapteurs et en biologie pour les physiciens.

Moyens techniques dont dispose le laboratoire

• Petits matériels : Matériels de microbiologie, appareils de mesures diverses (pH, oxymètre,..), balances, un purificateur d'eau, 7 PC.
• Equipement semi-lourd : 2 congélateurs à - 80°C, 4 réfrigérateurs +4 et -20°C, 2 bains thermostatés réfrigérés, 2 bain à sec ; 4 incubateurs, 2 agitateurs orbital thermostatés, 2 centrifugeuses,  1 centrifugeuse très haute vitesse (100.000g), 1 purificateur d'eau, 1 four pasteur, 1 autoclave, 1 microscope optique à épifluorescence. 3 spectrophotomètres UV/Visible. 1 lyophilisateur. 1 bioreacteur 2L équipé. 2 hottes à flux laminaire. 3 luminomètres (1 à microplaque, 2 à tubes), matériel de biologie moléculaire (2 PCR, générateur électrophorèse, électroporateur, 2 lecteurs de gel), Biocapteurs Lumisens 1, Lumisens 2 et 3 (en commun avec les autres membres du groupe de recherche).

Objectifs scientifiques

Le laboratoire a 4 objectifs principaux :

1. Ouvrir notre thématique principale « biocapteur » à leur intégration à des ensembles de procédés dédiés à l'environnement (biocapteur de contrôle de procédé de dépollution) et à l'agroalimentaire (biocapteur de contrôle de la qualité microbiologique). En effet, l évolution de nos recherches tend à l'application de nos biocapteurs à des procédés et à leur intégration dans une chaîne de décision. Poursuivre notre collaboration avec Biolumine en l'aidant dans son développement sur le site de La Roche-sur-Yon.
2. Elargir nos recherches vers d'autres systèmes de détection en lien avec l'industrie (par exemple projet BIORAM) mais aussi de développer une recherche amont pour étudier de nouveaux microorganismes intégrés ensuite dans nos biocapteurs.
3. Développer d'avantage l'axe "biodégradation" notamment par le biais d'une collaboration avec L'Oréal et notre participation active au Club Ecrin (Paris) axé sur l'étude de la persistance de molécules chimiques dans l'environnement.
4. Renforcer notre reconnaissance nationale et internationale dans le domaine des biocapteurs. A ce titre, et dans le cadre du CPER, un projet d'organisation d'un réseau régional piloté par la Roche sur Yon dans le but de fédérer un réseau de recherche dédié aux biocapteurs, capteurs et nanotechnologies. Le RBCN pour Réseau Biocapteur Capteurs et Nanotechnologies a pour objectif de regrouper l'ensemble des unités souhaitant développer des recherches collaboratives en interface et des innovations technologiques vers les entreprises avec pour finalités la mesure d'entité en environnement, agroalimentaire et santé. Actuellement, le réseau (informel) compte 23 unités de recherche ou centre de transfert technologique répartis sur le territoire ligérien.

Nous restons dans l'UMR GEPEA et nous avons une réflexion concernant une demande de labellisation ERT « Biodégradation » en partenariat avec L'Oréal.

• Conforter les liens avec l'UMR GEPEA avec intégration d'une partie de l'activité des membres du laboratoire dans les axes de l'UMR.
• Poursuivre nos collaborations avec l'Université du Maine.
• Se rapprocher des sciences humaines (laboratoire CERCI) avec notamment une collaboration en cours avec Maryse Souchard et Michel Goldberg sur la thèmatique de la "représentation de l'innovation". La difficulté majeure de nos recherches est son transfert vers l'industrie ou tout au moins vers une application (même si à la base, la recherche fondamentale prévaut). Aussi, le discours vers l'industrie et le public s'avère primordial afin de communiquer sur les nouvelles technologies.
• Faciliter la collaboration avec le département RT de la Roche sur Yon pour tout ce qui a trait aux transferts de données et aux réseaux de capteur que veut développer cette unité.
• Faire reconnaître nos activités à l'échelle internationale, notamment en participant à la structuration d'un pole régional lisible, dédié aux biocapteurs en général (réseau RBCN).
• Agrandir nos surfaces de laboratoire pour permettre un accueil d'étudiant et de chercheurs dans de bonne conditions (chercheurs académiques et privés, notamment la société Biolumine qui est incubées dans nos locaux).
• Participer aux cotés de nos collègues de Nantes, à un Master recherche typiquement « biocapteur ». Master pouvant être en commun avec le Mans qui a une spécificité « capteur » au niveau régional.